Трансформация системы духовного образования должна будет способствовать его признанию со стороны зарубежных вузов, образовательных сетей и агентств, а через них и со стороны отечественных образовательных структур, в первую очередь министерства образования. Студенты духовных школ смогут интегрироваться в отечественное и европейское пространство высшего образования и научных исследований. Но все это не составляет главной цели трансформации. По словам архимандрита Кирилла, изменения направлены в первую очередь на повышение уровня подготовки духовенства, преподавателей и научно-исследовательских кадров Русской Православной Церкви.