1. Евграф (Музалевский-Платонов), архимандрит (04.02.1809 — 11.11.1809)
2. Сергий (Крылов-Платонов), архимандрит (07.01.1810 — 03.03.1812)
3. Филарет (Дроздов), архимандрит, с 05.08.1817 — епископ Ревельский, викарий Санкт-Петербургской епархии, с 1814 г. – доктор богословия (11.03.1812 — 13.03.1819)
4. Григорий (Постников), архимандрит, с 07.05.1822 – епископ Ревельский, викарий Санкт-Петербургской епархии, с 1817 г. – доктор богословия (02.05.1819 — 04.01.1826)
5. Иоанн (Доброзраков), архимандрит, с 1825 г. – доктор богословия (30.01.1826 — 05.08.1830).
6. Смарагд (Крыжановский), архимандрит (27.08.1830 — 20.09.1831)
7. Венедикт (Григорович), архимандрит (04.11.1831 — 08.06.1833)
8. Виталий (Щепетев), архимандрит (08.06.1833 — 06.1837)
9. Николай (Доброхотов), архимандрит (05.07.1837 — 04.1841)
10. Афанасий (Дроздов), архимандрит с 15.08.1842 — епископ Винницкий, викарий Подольской епархии (21.04.1841 — 13.01.1847)
11. Евсевий (Орлинский), архимандрит с 09.03.1847 — епископ Винницкий, викарий Подольской епархии (17.01.1847 — 19.12.1850)
12. Макарий (Булгаков), архимандрит с 28.01.1851 — епископ Винницкий, викарий Подольской епархии, с 1847 г. -доктор богословия (20.12.1850 — 01.05.1857)
13. Феофан (Говоров), архимандрит (13.06.1857 — 09.05.1859)
14. Нектарий (Надеждин), архимандрит, с 13.09.1860 — епископ Выборгский, викарий Санкт-Петербургской епархии (17.07.1859 — 20.09.1860)
15. Иоанникий (Руднев), архимандрит (05.10.1860 — 13.01.1864)
16. Иоанн (Соколов), архимандрит, 17.01.1865 — епископ Выборгский, викарий Санкт-Петербургской епархии, с 1853 г. -доктор богословия (17.01.1864 — 09.11.1866)
17. Янышев Иоанн Леонтьевич, протоиерей (29.11.1866 — 19.10.1883)
18. Арсений (Брянцев), епископ Ладожский, викарий Санкт-Петербургской епархии (22.10.1883 — 28.03.1887)
19. Антоний (Вадковский), архимандрит с 03.05.1887 — епископ Выборгский, викарий Санкт-Петербургской епархии (15.04.1887 — 24.10.1892).
20. Борис (Плотников), архимандрит, с 09.05.1899 — епископ Ямбургский, викарий Санкт-Петербургской епархии (30.10.1892 — 2.12.1893; 17.02.1899 — 20.01.1901)
21. Никандр (Молчанов), епископ Нарвский, викарий Санкт-Петербургской епархии (13.12.1893 — 23.08.1895)
22. Иоанн (Кратиров), епископ Нарвский, викарий Санкт-Петербургской епархии (31.08.1895 — 16.01.1899)
23. Сергий (Страгородский), архимандрит, с 25.02.1901 — епископ Ямбургский, викарий Санкт-Петербургской епархии (24.01.1901 — 15.10.1905)
24. Сергий (Тихомиров), архимандрит, с 06.11.1905 — епископ Ямбургский, викарий Санкт-Петербургской епархии (15.10.1905 — 21.03.1908)
25. Феофан (Быстров), архимандрит, с 22.02.1909 по 19.10.1910 — епископ Ямбургский, викарий Санкт-Петербургской епархии (04.02.1909 — 19.10.1910)
26. Георгий (Ярошевский), епископ Ямбургский, викарий Санкт-Петербургской епархии (22.11.1910 — 13.05.1913)
27. Анастасий (Александров), епископ Ямбургский, викарий Санкт-Петербургской епархии, с 1910 г. — доктор церковной истории (30.05.1913 — 23.06.1918)
28. Зарин Сергей Михайлович, профессор (исполняющий обязанности с 10.07. по 12.12.1918)
29. Иоанн Богоявленский, профессор протоиерей, впоследствии епископ Таллиннский и Эстонский Исидор (01.09.1946 — 22.06.1947)
30. Осипов Александр, священник, (исполняющий обязанности 1947 — 1948 гг.)
31. Симеон (Бычков), епископ Лужский, викарий Ленинградской епархии (20.04.1948 — 30.06.1952)
32. Сперанский Михаил, профессор протоиерей (1952 — 16.08.1966)
33. Михаил (Мудьюгин), епископ Тихвинский, профессор; впоследствии архиепископ Вологодский и Великоустюжский (16.08.1966 — 30.07.1968).
34. Герман (Тимофеев), епископ Тихвинский, викарий Ленинградской епархии; ныне митрополит Волгоградский и Камышинский (28.11.1968 — 25.06.1970)
35. Мелитон (Соловьев), епископ Тихвинский (25.06.1970 — 26.12.1974)
36. Кирилл (Гундяев), архиепископ Выборгский, доцент; ныне Патриарх Московский и всея Руси (26.12.1974 — 26.12.1984)
37. Мануил (Павлов), архимандрит; митрополит Петрозаводский и Карельский (временно испол. обяз. 29.12.1984 — 02.03.1986)
38. Гундяев Николай, профессор протоиерей (исполняющий обязанности 02.03.1986 — 15.03.1986; утвержден 15.03.1986 — 22.06.1987)
39. Сорокин Владимир, профессор протоиерей (исполняющий обязанности 22.06.1987; утвержден 21.08.1987 — 12.08.1992)
40. Стойков Василий, профессор протоиерей (исполняющий обязанности 12.08.1992 — 19.07.1993; утвержден 19.07.1993 — 17.07.1996)
41. Константин (Горянов), профессор, архиепископ Тихвинский, викарий Санкт-Петербургской епархии, ныне митрополит Петрозаводский и Карельский (17.07.1996 — 06.10.2008).
42. Амвросий (Ермаков), архиепископ Петергофский, викарий Санкт-Петербургской епархии, ныне архиепископ Верейский, викарий Святейшего Патриарха Московского и всея Руси, ректор Московской Духовной Академии (06.10.2008 — 13.07.2018).
43. Серафим (Амельченков), епископ Петергофский, викарий Санкт-Петербургской епархии (14.07.2018 — 09.07.2019)
44. Силуан (Никитин), епископ Петергофский (09.07.2019 — ныне)