(1 сентября 1946 года — 22 июня 1947 года) ректор Ленинградской Духовной Академии

Сын псаломщика Курской епархии, младший брат митрополита Литовского и Виленского Елевферия (Богоявленского). Окончил Курскую Духовную Семинарию (1900) и Санкт-Петербургскую духовную академию со степенью кандидата богословия (1904). С 1904 г. — воспитатель Александро-Невского духовного училища. С 1905 г. — священник, с 1913 — протоиерей; служил в Ямбурге, с 1908 — в Кронштадте, с 1912 — в Гатчине. С 18 октября 1912 г. — благочинный 2-го округа Царскосельского уезда. 1915 г. — магистр богословия («Значение Иерусалимского храма в Ветхозаветной Истории еврейского народа». Пг. 1915). Сотрудник «Православной Богословской энциклопедии». В 1919 эмигрировал в Эстонию, служил в Симеоновской церкви в Таллине, был настоятелем Александро-Невского кафедрального собора, председателем Таллинского епархиального совета. В 1938 организовал в Таллине богословско-пастырские курсы, существовавшие до 1940. Участник съездов Русского студенческого христианского движения (РСХД) в Прибалтике, был председателем Ревельского отделения РСХД. Лектор Русского народного университета в Тарту. С 1 июня 1946 г. — ректор Ленинградских Богословско-Пастырских курсов. С 1 июля 1946 г. — ректор Ленинградской Духовной Семинарии, а с 1 сентября 1946 — по 12 мая 1947 одновременно ректор и профессор Ленинградской Духовной Академии. 12 мая 1947 г. наречен епископом Таллинским и Эстонским. Пострижен в монашество; хиротонисан 22 июня 1947. Похоронен на Александро-Невском кладбище Таллина, Эстония. Епископ Исидор являлся духовником будущего Святейшего Патриарха Алексия II. «Человек глубокой веры и очень большого духовного и жизненного опыта», — так характеризовал тогда еще протоиерея Иоанна Богоявленского Патриарх, продолжая: «И в семье, и мой духовник учили видеть доброе в людях, так было и у родителей, несмотря на все трудности, которые им приходилось преодолевать. Любовь и внимание к людям были теми критериями, которыми руководствовались и о. Иоанн, и мой отец» Использованы материалы:

• Сорокин В.,прот. Исповедник. Церковно-просветительская деятельность митрополита Григория (Чукова). СПб., 2005. С.583;
• Преемство. СПб. Князь-Владимирского собор, 2007. С.13;
• Памяти Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия. http://www.patriarchia.ru