На набережной Обводного канала рядом с историческим зданием Санкт-Петербургской Духовной Академии стоит трехэтажный дом. В 1882 году его построил архитектор Д.В. Люшин, и до революции 1917 года оно служило библиотекой Духовной Академии города на Неве. Потом здание не раз меняло свое назначение, но с 1965 года половина здания стала служить как фондохранилище Российской национальной библиотеки. 20 марта 2018 года был подписан акт о передаче этого здания в собственность Санкт-Петербургской Духовной Академии во исполнение Федерального закона «О передаче религиозным организациям имущества религиозного назначения, находящегося в государственной и муниципальной собственности». Акт о передаче подписали ректор Санкт-Петербургской Духовной Академии архиепископ Петергофский Амвросий, заместитель руководителя Межрегионального Территориального управления Федерального агентства по управлению государственным имуществом в городе Санкт-Петербурге и Ленинградской области С.И. Шульженко и исполняющая обязанности генерального директора Федерального государственного бюджетного учреждения «Российская национальная библиотека» Е.В. Тихонова. Акт передачи объектов недвижимости утвердил руководитель МТУ Росимущества Санкт-Петербурга С. В.Рудовский. Станислав Рудовский:

«В России Церковь является хранительницей истории и традиций, поэтому я уверен, что мы передаем библиотеку из хороших рук в надёжные».

После подписания владыка ректор выразил надежду, что библиотека после капитального ремонта станет доступным центром не только для студентов Академии и жителей города, но и для всех, кто занимается богословской наукой. Он поблагодарил сотрудников Российской национальной библиотеки и МТУ Росимущества Санкт-Петербурга. Это второй объект, который вернулся в состав Духовной Академии в соответствии с федеральным законом «О передаче религиозным организациям имущества религиозного назначения». В 2013 году Академии был возвращен комплекс исторических зданий с домовым храмом Двенадцати апостолов по адресу наб. Обводного канала 7. Ранее, в 2009 году, благодаря позиции Губернатора В.И. Матвиенко, город передал Духовной Академии принадлежавшее ей до Октябрьского переворота историческое здание из комплекса Духовной семинарии по адресу Обводный, 15, которое в настоящее время полностью восстановлено. Пресс-служба СПбДА